テレビシリーズ全254話の中からお気に入りを投票する『あなたの推しエピソード総選挙』(7/1〜7/31)。
この度は、たくさんの方にご参加いただき誠にありがとうございました。
下記にて、上位30位のランキングを発表いたします。
| 順位 | シーズン | タイトル | 放送年月日 |
| 1 | シーズン20 第1話 | マリコに殺意20年!? 謎の逆恨み女と空飛ぶ女子高生!! | 2020/10/22 |
| 2 | シーズン20 第6話 | 死体が歩いて干物を買った!? 白い粉が暴く美女の嘘!! | 2020/11/26 |
| 3 | シーズン12 第5話 | 殉職刑事が残した謎 血液指紋の告発・・・ | 2013/2/14 |
| 4 | シーズン17 第1話 | 衝撃スタート！緊縛マリコVS新人研究員の凍死実験!? | 2017/10/19 |
| 5 | シーズン16 第16話 | マリコｖｓバスジャック犯!100均グッズで決死の鑑定 | 2017/3/2 |
| 6 | シーズン19 第3話 | マリコVSカナダから飛んできた銃弾!? 目撃者はカモメ | 2019/5/2 |
| 7 | シーズン6 第9話 | どうするマリコ！灼熱５０度の監禁状態！！ | 2005/9/8 |
| 8 | シーズン1 第1話 | 声紋は語る！京都大文字の夜 謎の女が・・・ | 1999/10/21 |
| 9 | シーズン7 第1話 | 京都の祭りに人が死ぬ！！祇園祭を襲う二つの事件！ | 2006/7/6 |
| 10 | シーズン8 第5話 | ７年目の白骨死体！結婚指輪が語る過去 | 2008/5/22 |
| 11 | 2017年スペシャル | 決死の大追跡！猛毒を運ぶ逃亡犯VS最新鋭ドローン!! 土門を襲う暴走列車…マリコ、涙の検視！衝撃ラスト | 2017/10/15 |
| 11 | シーズン1 第4話 | 哀しみの復顔！夫に話せない美人妻の過去 | 1999/11/11 |
| 12 | シーズン15 第15話 | マリコ最後の鑑定！完全犯罪を暴く衝撃のＤＮＡ奪取 | 2016/3/10 |
| 13 | シーズン4 第8話 | 疑惑の誘拐 京都タワーが見える監禁場所を探せ！ 手がかりは一枚の写真だけ！！ | 2002/9/19 |
| 13 | シーズン17 第18話 | 最後の鑑定 マリコVS未来が見える暗殺者!? 土門を狙う謎の銃弾!! 殉職!? 最新鋭セキュリティの盲点…衝撃ラスト | 2018/3/22 |
| 14 | 2014年年末スペシャル | 白骨死体は30年前に夜逃げした親友!? 涙と執念のDNA型鑑定！東京〜大阪1100キロの大捜査！ 繁華街の大爆破 迫る女探偵の罠〜マリコの過去が明白に!! | 2014/12/21 |
| 15 | シーズン13 第3話 | 狙われた観光名所！科捜研ＶＳサイバー犯罪疑惑の合成写真！！ | 2013/10/31 |
| 16 | シーズン14 第6話 | 欲望の殺人実験室！リケジョと裏金の陰謀 鑑定不能の粉末血液 | 2014/11/20 |
| 16 | シーズン12 第4話 | 疑惑の白骨死体！残された押収拳銃の謎 | 2013/1/31 |
| 17 | シーズン２ 第2話 | 記憶を失くした目撃者・チョコアイスが見た殺人！ | 2000/10/26 |
| 17 | シーズン17 第9話 | 姿なき狙撃犯VS監禁されたマリコ！脱いだ晴れ着で銃弾鑑定!? | 2018/1/18 |
| 17 | シーズン19 第29話 | マリコ銭湯アイドル徹底解剖!! 白骨を贈る熱烈ファン | 2020/2/6 |
| 18 | シーズン19 第31話 | マリコVS色の魔術師 10円でピンクに変わる犯行声明!? | 2020/2/20 |
| 18 | シーズン1 第5話 | 京都死の配達人！赤いルージュの殺意 | 1999/11/18 |
| 19 | シーズン16 第8話 | さらば科捜研！絶対止まらない爆弾の罠…衝撃ラスト | 2016/12/15 |
| 19 | 2015年新春スペシャル | 科学捜査vs祟りの村恐竜の化石発掘現場から出現した白骨死体！ 京都〜日本海を結ぶ奇妙な手紙！わらべ唄通りに連続殺人が!! 鑑定が告げる壮絶な真実 | 2015/1/18 |
| 20 | シーズン1 第9話 | 美しき女医の正体！危険な誘惑の果て・・・ | 1999/12/16 |
| 20 | シーズン1 第6話 | 足だけの死体の謎！学校の怪談京都編！ | 1999/11/25 |
| 20 | シーズン9 第1話 | ２０年目の殺人連鎖！なぜ私たちが狙われる姿なき脅迫者！！ | 2009/7/2 |
| 21 | シーズン20 第2話 | ハロウィーン殺人!! マリコ土門のコスプレ潜入捜査!? | 2020/10/29 |
| 21 | シーズン19 第22話 | マリコVS推理作家!? 殺人犯が集うサイン会と葛餅の謎 | 2019/11/28 |
| 22 | シーズン5 第1話 | 長崎－京都８００キロブルートレインの殺意 ひとしずくの透明な水に隠された赤い秘密 | 2004/4/15 |
| 22 | シーズン19 第2話 | 時価2億!? イタズラ壁画殺人!! 科学が暴く画家の正体 | 2019/4/25 |
| 22 | シーズン17 第13話 | 宇宙から来た凶器!? 巨大なバラと回転する遺体の謎!! | 2018/2/15 |
| 22 | シーズン19 第16話 | 衝撃ラスト!! 凶弾に撃たれた風丘先生…骨が暴く真実 | 2019/9/5 |
| 22 | シーズン10 第1話 | 狙われた科捜研！残された指紋 | 2010/7/8 |
| 22 | シーズン18 第5話 | 凶器をフリマアプリで売る女!?マリコ決死の爆買い!! | 2018/11/22 |
| 23 | シーズン1 第3話 | 涙の不倫 嘘発見器が暴く女教師死の真実 | 1999/11/4 |
| 23 | シーズン19 第1話 | マリコVS科警研の女 1年以上続く鑑定バトル | 2019/4/18 |
| 23 | シーズン11 第8話 | 隠された発火装置！連続放火、消された指紋の秘密！！ | 2011/12/8 |
| 23 | シーズン18 第3話 | マリコが嫉妬!?美人容疑者の“1000倍吸水トリック” | 2018/11/8 |
| 23 | シーズン19 第17話 | マリコの自宅に爆弾犯が居候!? 水漏れする偽夫婦の謎 | 2019/10/17 |
| 24 | シーズン15 第1話 | マリコｖｓ死神と呼ばれた女刑事！鑑定の盲点を突いた肌色の銃弾！！ | 2015/10/15 |
| 25 | 2018年スペシャル | マリコVS謎の誘拐犯…身代金は五重の塔!? 人質殺害まで24時間、決死の救出作戦！ 完全密室の盲点を透視するレーザーと海ブドウ | 2018/10/14 |
| 25 | 2019年正月スペシャル | 土門、最後の事件へ… マリコVS連続爆発犯予測不能の起爆装置とマイナス10℃の殺意！ 衝撃クライマックス | 2019/1/3 |
| 26 | 2013年クリスマススペシャル | 疑惑の観光タクシー予告された転落事故！ 奇妙なタイヤ痕、飛沫血痕の罠!! 冤罪を生んだ鑑定ミス!? 父親に尋問されるマリコ！辞職を要求する元管理官！ | 2013/12/25 |
| 27 | シーズン16 第1話 | 美女誘拐！覆面犯を透視する０．２秒の微表情解析！！ | 2016/10/20 |
| 27 | シーズン13 第7話 | 過去から来たテロリスト！獄中の鑑定対決 マリコＶＳ殺人科学者 | 2013/11/28 |
| 28 | シーズン20 第9話 | 被疑者:土門薫/ 史上最強の敵、現る〜マリコVS殺人容疑者土門！ 最新科学の盲点をついた密室トリック 20時間の罠 | 2020/12/17 |
| 28 | シーズン15 第5話 | 致死率１００％の密室閉じ込められたマリコの殺人鑑定 | 2015/11/19 |
| 28 | シーズン３ 第6話 | ＶＳアンビリバボー！女子寮に潜む美しき霊の謎！！ | 2001/12/6 |
| 28 | シーズン15 第8話 | スペシャリスト緊急参戦！完全犯罪を暴く生きた人間の検死！？ | 2016/1/14 |
| 28 | シーズン9 第3話 | 非情の鑑定結果！殺人犯になった親友 | 2009/7/16 |
| 28 | シーズン20 第3話 | 殺人犯は激辛好き!? タバスコの1000倍辛いインコの謎 | 2020/11/5 |
| 28 | シーズン17 第14話 | 幕末から来た殺人犯マリコVSダンダラ模様の羽織の謎 | 2018/2/22 |
| 29 | シーズン18 第4話 | 殺された着ぐるみ!?マリコVSパワハラ美女の絶叫鑑定 | 2018/11/15 |
| 29 | シーズン19 第4話 | マリコVS8億円ネコ 肉球鑑定が暴く緑色の汗の殺人犯 | 2019/5/9 |
| 29 | シーズン1 第8話 | 連続殺人を結ぶ美女！死を誘う光の謎！！ | 1999/12/9 |
| 29 | シーズン17 第17話 | 200回スペシャル！科捜研、解散の危機!? 衝撃ラスト | 2018/3/15 |
| 29 | シーズン19 第14話 | 被害者が殺人を生前予約!? マリコVS証拠を火葬する女 | 2019/8/22 |
| 29 | シーズン1 第7話 | 祇園ホステス殺人の謎！二度狙われた女！！ | 1999/12/2 |
| 29 | シーズン15 第7話 | 美食家殺人！！ゴーヤの５倍苦い毒殺レシピの味覚鑑定 | 2015/12/3 |
| 29 | シーズン16 第5話 | 殺人現場を消す女！掃除の達人ｖｓマリコの大根おろし | 2016/11/24 |
| 30 | 2017年正月スペシャル | 列島大追跡！マリコvs誘拐殺人犯～ 24年前の未解決事件が今また動き出す!! 刑事を狙う自動走行バイクと空飛ぶ身代金3000万円の謎を飛行機雲が解く！ | 2017/1/3 |
| 30 | シーズン19 第19話 | マリコの部下は刑事部長!? 殺人現場を再現する謎の芋 | 2019/11/7 |
| 30 | シーズン9 第4話 | 告発された司法解剖 追いつめられた女医 | 2009/7/30 |
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